一种吸附破伤疫苗后工艺脱毒控制系统及工艺方法目的即在于克服现有技术的不足，提供一种脱毒搅拌过程和温度控制过程自动化，可全程监控脱毒温度的吸附破伤疫苗后工艺脱毒控制系统及工艺方法。本发明的有益效果是:一种吸附破伤疫苗后工艺脱毒控制系统及工艺方法，采用控制系统统一控制全封闭式搅拌装置和温度控制装置，将多个脱毒容器并联于一个温度控制装置，具有脱毒过程搅拌自动化，取样精准化，避免了取样差异，脱毒期间可全过程监控温度，并自动记录及根据需要输出打印相应温度等优点。